Divisi malaria memiliki track record yang cukup panjang dalam penelitian malaria di Indonesia, terutama di bidang imunologi malaria termasuk serologi malaria di daerah dengan endemisitas malaria yang rendah dan tinggi  serta  penggunaan  spatial  analysis  untuk  transmisi  malaria.  Divisi  malaria  juga  telah  membangun kerjasama yang kuat dengan berbagai partner di tingkat nasional maupun internasional. Partner di tingkat nasional antara lain adalah Subdirektorat Malaria Kementerian Kesehatan RI, Kementerian Ristekdik, Dinas Kesehatan di berbagai provinsi dan kabupaten, UNICEF Indonesia, Eijkman Instute, dan organisasi profesi. Adapun  partner  internasional  antara  lain  adalah  WHO/TDR,  Asia  Pacific  Malaria  Elimination  Network (APMEN), London School of Hygiene and Tropical Medicine, dan berbagai partner lain di bidang penelitian malaria.

Penelitian

Tahun	Penelitian
2013 – 2015	Serological Survey of angenic markers related to malaria transmission in Sabang Aceh dan NTT
2013 – 2017	Serological Study Malaria in Free malaria areas of Kepulauan Seribu DKI and Bali
2013 – 2014	Spatial analysis of the incidence of G6PD mutations in plasmodium malaria infeticon in South Central Timor ( SCT), East Nusa Tenggara (ENT ) Province, Indonesia